L’AFEQ a été fondée en 1962 pour promouvoir l’étude du Quaternaire. C’est un groupe pluridisciplinaire qui rassemble des représentants de tous les champs scientifiques concernés par cette période : archéologues, botanistes, climatologues, géographes, géologues, géophysiciens, paléontologues, palynologues, pédologues et zoologistes. L’Association est ouverte à tous les quaternaristes, français ou étrangers. Elle édite la revue Quaternaire, organise une excursion annuelle, des colloques et informe ses membres sur l’actualité de la recherche chaque trimestre. En Juillet 2012 la fusion-absorption des deux associations françaises de quaternaristes, l’AFEQ et le CNF INQUA a été publiée au journal officiel, et la nouvelle association renommée « AFEQ-CNF INQUA ».